El CIO es una institución líder a nivel nacional en las áreas de la óptica y la fotónica y su presencia a nivel internacional, ha ido en aumento. Este liderazgo tiene como base la generación de conocimiento de frontera en nuestras áreas estratégicas de investigación:

• Metrología Óptica
• Ingeniería Óptica
• Fotónica
• Fibras Ópticas y Láseres
• Óptica no lineal
• Materiales Ópticos
• Óptica Cuántica
• Visión Robótica e Inteligencia Artificial
• Energías Renovables

A partir de estas, se tiene impacto principalmente en los sectores de comunicaciones, metrología, energía, salud, alimentos y manufactura.

Todas las áreas de investigación del CIO están articuladas para resolver proyectos específicos y multidisciplinarios a través de tres Departamentos:

• Atención a problemas nacionales
• Ciencia básica y de frontera
• Consolidación y desarrollo de nuevas tecnologías